La Fundación Museo del Mar de Ceuta fue creada en junio de 2006 con el objetivo de proteger y conservar el litoral como medio marino y patrimonio histórico y cultural en el Estrecho. Desde sus inicios la fundación ha sido considerada un referente en la gestión y conservación del Mediterráneo occidental, en concreto, en el Mar de Alborán y Canarias.
El espacio tiene la intención de crear una concienciación sobre la sostenibilidad territorial y la necesaria optimización de los recursos patrimoniales, naturales, históricos y culturales para conseguir un desarrollo completo.
La fundación cuenta con más de 15 años de trabajo a sus espaldas con diferentes estudios científicos que se centran en la conservación de especies marinas y sus hábitats. El espacio es usado para conferencias, eventos y visitas para la correcta divulgación del conocimiento.
Visitar la fundación supone un viaje por el fondo marino, una experiencia para todo aquel que quiera aprender.